Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

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Length 659 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HKR1P10072 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HKR1P10072 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HKR1P10072 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HKR1P10072 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HKR1P10072 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HKR1P10072 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HKR1P10072 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HKR1P10072 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HKR1P10072 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HKR1P10072 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HKR1P10072 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HKR1P10072 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HKR1P10072 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HKR1P10072 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HKR1P10072 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HKR1P10072 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HKR1P10072 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HKR1P10072 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HKR1P10072 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HKR1P10072 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HKR1P10072 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HKR1P10072 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HKR1P10072 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HKR1P10072 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HKR1P10072 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HKR1P10072 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HKR1P10072 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HKR1P10072 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HKR1P10072 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HKR1P10072 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HKR1P10072 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HKR1P10072 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HKR1P10072 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HKR1P10072 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HKR1P10072 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HKR1P10072 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HKR1P10072 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HKR1P10072 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HKR1P10072 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HKR1P10072 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HKR1P10072 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HKR1P10072 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HKR1P10072 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HKR1P10072 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HKR1P10072 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HKR1P10072 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HKR1P10072 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HKR1P10072 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HKR1P10072 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HKR1P10072 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HKR1P10072 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HKR1P10072 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HKR1P10072 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HKR1P10072 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HKR1P10072 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HKR1P10072 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HKR1P10072 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HKR1P10072 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HKR1P10072 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HKR1P10072 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HKR1P10072 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HKR1P10072 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HKR1P10072 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HKR1P10072 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HKR1P10072 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HKR1P10072 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HKR1P10072 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HKR1P10072 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HKR1P10072 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HKR1P10072 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HKR1P10072 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HKR1P10072 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HKR1P10072 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HKR1P10072 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HKR1P10072 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HKR1P10072 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HKR1P10072 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HKR1P10072 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HKR1P10072 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HKR1P10072 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HKR1P10072 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HKR1P10072 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HKR1P10072 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HKR1P10072 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HKR1P10072 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HKR1P10072 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HKR1P10072 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HKR1P10072 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HKR1P10072 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HKR1P10072 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HKR1P10072 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HKR1P10072 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HKR1P10072 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HKR1P10072 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HKR1P10072 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HKR1P10072 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HKR1P10072 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HKR1P10072 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HKR1P10072 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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