Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms