Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms