Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms