Protein–RNA interactions for Protein: O94972

TRIM37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM37O94972 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM37O94972 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM37O94972 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM37O94972 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM37O94972 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM37O94972 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM37O94972 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM37O94972 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM37O94972 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM37O94972 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM37O94972 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM37O94972 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM37O94972 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM37O94972 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM37O94972 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM37O94972 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM37O94972 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM37O94972 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM37O94972 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM37O94972 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM37O94972 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM37O94972 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM37O94972 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM37O94972 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM37O94972 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM37O94972 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM37O94972 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM37O94972 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM37O94972 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM37O94972 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM37O94972 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM37O94972 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM37O94972 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM37O94972 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM37O94972 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM37O94972 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM37O94972 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM37O94972 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM37O94972 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRIM37O94972 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRIM37O94972 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRIM37O94972 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRIM37O94972 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM37O94972 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM37O94972 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM37O94972 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM37O94972 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM37O94972 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM37O94972 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM37O94972 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM37O94972 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM37O94972 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM37O94972 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM37O94972 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM37O94972 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM37O94972 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM37O94972 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM37O94972 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM37O94972 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM37O94972 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM37O94972 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM37O94972 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM37O94972 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM37O94972 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM37O94972 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM37O94972 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM37O94972 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM37O94972 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM37O94972 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM37O94972 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM37O94972 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM37O94972 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM37O94972 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM37O94972 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM37O94972 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM37O94972 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM37O94972 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM37O94972 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM37O94972 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM37O94972 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM37O94972 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM37O94972 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM37O94972 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM37O94972 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM37O94972 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM37O94972 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM37O94972 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM37O94972 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM37O94972 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM37O94972 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM37O94972 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM37O94972 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM37O94972 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM37O94972 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM37O94972 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM37O94972 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM37O94972 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM37O94972 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM37O94972 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM37O94972 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms