Protein–RNA interactions for Protein: O60542

PSPN, Persephin, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPNO60542 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSPNO60542 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSPNO60542 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSPNO60542 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSPNO60542 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSPNO60542 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSPNO60542 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSPNO60542 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSPNO60542 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSPNO60542 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSPNO60542 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSPNO60542 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSPNO60542 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PSPNO60542 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSPNO60542 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSPNO60542 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSPNO60542 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSPNO60542 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSPNO60542 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSPNO60542 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PSPNO60542 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSPNO60542 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSPNO60542 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSPNO60542 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSPNO60542 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSPNO60542 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSPNO60542 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSPNO60542 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSPNO60542 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSPNO60542 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSPNO60542 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSPNO60542 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PSPNO60542 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSPNO60542 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PSPNO60542 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSPNO60542 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSPNO60542 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PSPNO60542 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSPNO60542 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSPNO60542 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSPNO60542 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSPNO60542 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSPNO60542 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSPNO60542 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSPNO60542 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSPNO60542 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PSPNO60542 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
PSPNO60542 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSPNO60542 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSPNO60542 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSPNO60542 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSPNO60542 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSPNO60542 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSPNO60542 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSPNO60542 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSPNO60542 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSPNO60542 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSPNO60542 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSPNO60542 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSPNO60542 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSPNO60542 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PSPNO60542 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSPNO60542 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSPNO60542 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSPNO60542 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSPNO60542 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSPNO60542 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PSPNO60542 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSPNO60542 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSPNO60542 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSPNO60542 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSPNO60542 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSPNO60542 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSPNO60542 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSPNO60542 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSPNO60542 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSPNO60542 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PSPNO60542 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSPNO60542 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSPNO60542 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSPNO60542 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSPNO60542 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSPNO60542 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSPNO60542 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSPNO60542 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSPNO60542 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSPNO60542 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSPNO60542 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSPNO60542 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSPNO60542 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSPNO60542 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSPNO60542 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSPNO60542 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSPNO60542 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PSPNO60542 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSPNO60542 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSPNO60542 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSPNO60542 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSPNO60542 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSPNO60542 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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