Protein–RNA interactions for Protein: O60506

SYNCRIP, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCRIPO60506 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNCRIPO60506 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNCRIPO60506 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNCRIPO60506 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNCRIPO60506 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNCRIPO60506 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNCRIPO60506 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNCRIPO60506 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNCRIPO60506 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNCRIPO60506 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNCRIPO60506 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNCRIPO60506 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNCRIPO60506 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms