Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP104O60308 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP104O60308 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP104O60308 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP104O60308 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP104O60308 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP104O60308 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP104O60308 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP104O60308 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP104O60308 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP104O60308 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP104O60308 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP104O60308 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP104O60308 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP104O60308 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP104O60308 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP104O60308 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP104O60308 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP104O60308 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP104O60308 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP104O60308 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP104O60308 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP104O60308 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP104O60308 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP104O60308 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP104O60308 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP104O60308 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP104O60308 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP104O60308 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP104O60308 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP104O60308 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP104O60308 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP104O60308 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP104O60308 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP104O60308 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP104O60308 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP104O60308 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP104O60308 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP104O60308 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP104O60308 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP104O60308 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP104O60308 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP104O60308 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP104O60308 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP104O60308 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP104O60308 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP104O60308 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP104O60308 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP104O60308 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP104O60308 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP104O60308 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP104O60308 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP104O60308 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP104O60308 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP104O60308 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP104O60308 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP104O60308 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP104O60308 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP104O60308 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP104O60308 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP104O60308 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP104O60308 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP104O60308 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP104O60308 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP104O60308 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP104O60308 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP104O60308 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP104O60308 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP104O60308 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP104O60308 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP104O60308 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP104O60308 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP104O60308 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP104O60308 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP104O60308 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP104O60308 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP104O60308 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP104O60308 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP104O60308 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP104O60308 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP104O60308 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP104O60308 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP104O60308 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP104O60308 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP104O60308 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP104O60308 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP104O60308 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP104O60308 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP104O60308 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP104O60308 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP104O60308 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP104O60308 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP104O60308 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP104O60308 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP104O60308 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP104O60308 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP104O60308 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP104O60308 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP104O60308 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP104O60308 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms