Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms