Protein–RNA interactions for Protein: O15146

MUSK, Muscle, skeletal receptor tyrosine-protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUSKO15146 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MUSKO15146 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MUSKO15146 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MUSKO15146 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MUSKO15146 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MUSKO15146 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MUSKO15146 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MUSKO15146 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MUSKO15146 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MUSKO15146 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MUSKO15146 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MUSKO15146 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MUSKO15146 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MUSKO15146 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MUSKO15146 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MUSKO15146 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MUSKO15146 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MUSKO15146 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MUSKO15146 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MUSKO15146 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MUSKO15146 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MUSKO15146 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MUSKO15146 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MUSKO15146 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MUSKO15146 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MUSKO15146 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
MUSKO15146 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MUSKO15146 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MUSKO15146 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MUSKO15146 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MUSKO15146 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MUSKO15146 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MUSKO15146 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MUSKO15146 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MUSKO15146 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MUSKO15146 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MUSKO15146 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MUSKO15146 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MUSKO15146 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MUSKO15146 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MUSKO15146 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MUSKO15146 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MUSKO15146 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MUSKO15146 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MUSKO15146 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MUSKO15146 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MUSKO15146 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MUSKO15146 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MUSKO15146 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MUSKO15146 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MUSKO15146 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MUSKO15146 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MUSKO15146 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MUSKO15146 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MUSKO15146 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MUSKO15146 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MUSKO15146 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MUSKO15146 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MUSKO15146 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MUSKO15146 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MUSKO15146 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MUSKO15146 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MUSKO15146 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MUSKO15146 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MUSKO15146 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MUSKO15146 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MUSKO15146 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MUSKO15146 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MUSKO15146 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MUSKO15146 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MUSKO15146 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MUSKO15146 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MUSKO15146 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MUSKO15146 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MUSKO15146 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MUSKO15146 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MUSKO15146 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MUSKO15146 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MUSKO15146 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MUSKO15146 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MUSKO15146 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MUSKO15146 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MUSKO15146 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MUSKO15146 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MUSKO15146 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MUSKO15146 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MUSKO15146 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MUSKO15146 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MUSKO15146 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MUSKO15146 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MUSKO15146 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MUSKO15146 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MUSKO15146 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MUSKO15146 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MUSKO15146 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MUSKO15146 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MUSKO15146 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MUSKO15146 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MUSKO15146 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MUSKO15146 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms