Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
KDM6BO15054 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms