Protein–RNA interactions for Protein: O15013

ARHGEF10, Rho guanine nucleotide exchange factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF10O15013 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGEF10O15013 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms