Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLGNO14967 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLGNO14967 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLGNO14967 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLGNO14967 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CLGNO14967 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CLGNO14967 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLGNO14967 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLGNO14967 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLGNO14967 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLGNO14967 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLGNO14967 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CLGNO14967 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLGNO14967 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLGNO14967 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLGNO14967 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLGNO14967 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLGNO14967 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLGNO14967 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLGNO14967 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLGNO14967 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLGNO14967 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLGNO14967 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLGNO14967 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CLGNO14967 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLGNO14967 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CLGNO14967 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLGNO14967 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLGNO14967 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLGNO14967 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLGNO14967 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLGNO14967 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLGNO14967 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLGNO14967 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLGNO14967 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLGNO14967 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLGNO14967 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLGNO14967 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLGNO14967 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLGNO14967 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLGNO14967 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLGNO14967 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLGNO14967 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLGNO14967 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLGNO14967 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLGNO14967 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLGNO14967 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLGNO14967 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLGNO14967 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLGNO14967 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLGNO14967 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLGNO14967 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLGNO14967 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLGNO14967 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CLGNO14967 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLGNO14967 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLGNO14967 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLGNO14967 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLGNO14967 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLGNO14967 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLGNO14967 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLGNO14967 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLGNO14967 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLGNO14967 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLGNO14967 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLGNO14967 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLGNO14967 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLGNO14967 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLGNO14967 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLGNO14967 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLGNO14967 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLGNO14967 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLGNO14967 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLGNO14967 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLGNO14967 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLGNO14967 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CLGNO14967 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLGNO14967 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLGNO14967 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLGNO14967 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLGNO14967 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLGNO14967 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLGNO14967 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLGNO14967 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLGNO14967 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CLGNO14967 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLGNO14967 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLGNO14967 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLGNO14967 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLGNO14967 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLGNO14967 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLGNO14967 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLGNO14967 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLGNO14967 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLGNO14967 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLGNO14967 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLGNO14967 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLGNO14967 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLGNO14967 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLGNO14967 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms