Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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