Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H7C1D1 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H7C1D1 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
H7C1D1 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
H7C1D1 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H7C1D1 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
H7C1D1 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
H7C1D1 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
H7C1D1 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
H7C1D1 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
H7C1D1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H7C1D1 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
H7C1D1 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H7C1D1 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H7C1D1 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
H7C1D1 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H7C1D1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
H7C1D1 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
H7C1D1 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H7C1D1 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H7C1D1 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H7C1D1 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
H7C1D1 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
H7C1D1 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H7C1D1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H7C1D1 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
H7C1D1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H7C1D1 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H7C1D1 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
H7C1D1 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
H7C1D1 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H7C1D1 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
H7C1D1 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
H7C1D1 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H7C1D1 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
H7C1D1 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
H7C1D1 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
H7C1D1 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H7C1D1 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
H7C1D1 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H7C1D1 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
H7C1D1 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H7C1D1 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
H7C1D1 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
H7C1D1 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
H7C1D1 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
H7C1D1 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
H7C1D1 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
H7C1D1 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
H7C1D1 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
H7C1D1 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
H7C1D1 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
H7C1D1 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
H7C1D1 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
H7C1D1 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
H7C1D1 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
H7C1D1 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
H7C1D1 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
H7C1D1 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
H7C1D1 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
H7C1D1 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
H7C1D1 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
H7C1D1 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
H7C1D1 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
H7C1D1 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
H7C1D1 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
H7C1D1 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
H7C1D1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
H7C1D1 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H7C1D1 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H7C1D1 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
H7C1D1 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H7C1D1 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H7C1D1 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
H7C1D1 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H7C1D1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H7C1D1 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H7C1D1 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H7C1D1 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
H7C1D1 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H7C1D1 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
H7C1D1 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
H7C1D1 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H7C1D1 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
H7C1D1 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
H7C1D1 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
H7C1D1 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
H7C1D1 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
H7C1D1 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
H7C1D1 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
H7C1D1 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H7C1D1 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
H7C1D1 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H7C1D1 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H7C1D1 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
H7C1D1 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H7C1D1 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
H7C1D1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H7C1D1 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
H7C1D1 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms