Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E9PBE3 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E9PBE3 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E9PBE3 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E9PBE3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E9PBE3 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E9PBE3 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E9PBE3 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E9PBE3 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E9PBE3 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E9PBE3 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E9PBE3 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E9PBE3 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E9PBE3 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E9PBE3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E9PBE3 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E9PBE3 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E9PBE3 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E9PBE3 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E9PBE3 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E9PBE3 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E9PBE3 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E9PBE3 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E9PBE3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E9PBE3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E9PBE3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E9PBE3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
E9PBE3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E9PBE3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E9PBE3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E9PBE3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E9PBE3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E9PBE3 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E9PBE3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E9PBE3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E9PBE3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E9PBE3 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
E9PBE3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E9PBE3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E9PBE3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E9PBE3 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
E9PBE3 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E9PBE3 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E9PBE3 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E9PBE3 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E9PBE3 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E9PBE3 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E9PBE3 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E9PBE3 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E9PBE3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E9PBE3 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E9PBE3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E9PBE3 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E9PBE3 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E9PBE3 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E9PBE3 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E9PBE3 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E9PBE3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E9PBE3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E9PBE3 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E9PBE3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E9PBE3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E9PBE3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E9PBE3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E9PBE3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
E9PBE3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E9PBE3 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
E9PBE3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E9PBE3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E9PBE3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
E9PBE3 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E9PBE3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E9PBE3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E9PBE3 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E9PBE3 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E9PBE3 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E9PBE3 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E9PBE3 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E9PBE3 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E9PBE3 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E9PBE3 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E9PBE3 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E9PBE3 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E9PBE3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E9PBE3 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E9PBE3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E9PBE3 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E9PBE3 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E9PBE3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E9PBE3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E9PBE3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E9PBE3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E9PBE3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E9PBE3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E9PBE3 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E9PBE3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E9PBE3 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E9PBE3 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E9PBE3 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E9PBE3 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms