Protein–RNA interactions for Protein: B7ZW38

HNRNPCL3, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPCL3B7ZW38 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms