Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVV-1B6SEH8 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms