Protein–RNA interactions for Protein: A6NHT5

HMX3, Homeobox protein HMX3, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX3A6NHT5 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms