Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms