Protein–RNA interactions for Protein: A6NFR6

C5orf60, Putative uncharacterized protein C5orf60, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf60A6NFR6 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C5orf60A6NFR6 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms