Protein–RNA interactions for Protein: A2VEC9

SSPO, SCO-spondin, humanhuman

Predictions only

Length 5,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPOA2VEC9 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
SSPOA2VEC9 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSPOA2VEC9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSPOA2VEC9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSPOA2VEC9 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSPOA2VEC9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSPOA2VEC9 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSPOA2VEC9 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSPOA2VEC9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SSPOA2VEC9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSPOA2VEC9 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSPOA2VEC9 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSPOA2VEC9 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSPOA2VEC9 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSPOA2VEC9 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSPOA2VEC9 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSPOA2VEC9 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSPOA2VEC9 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSPOA2VEC9 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSPOA2VEC9 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SSPOA2VEC9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSPOA2VEC9 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSPOA2VEC9 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSPOA2VEC9 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSPOA2VEC9 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SSPOA2VEC9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSPOA2VEC9 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSPOA2VEC9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSPOA2VEC9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSPOA2VEC9 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSPOA2VEC9 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SSPOA2VEC9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSPOA2VEC9 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSPOA2VEC9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSPOA2VEC9 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSPOA2VEC9 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSPOA2VEC9 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSPOA2VEC9 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSPOA2VEC9 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SSPOA2VEC9 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SSPOA2VEC9 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSPOA2VEC9 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSPOA2VEC9 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSPOA2VEC9 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSPOA2VEC9 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSPOA2VEC9 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSPOA2VEC9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSPOA2VEC9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSPOA2VEC9 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSPOA2VEC9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSPOA2VEC9 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSPOA2VEC9 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSPOA2VEC9 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSPOA2VEC9 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSPOA2VEC9 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSPOA2VEC9 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSPOA2VEC9 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSPOA2VEC9 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSPOA2VEC9 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSPOA2VEC9 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSPOA2VEC9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSPOA2VEC9 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSPOA2VEC9 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSPOA2VEC9 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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