Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms