Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COG6Q9Y2V7 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COG6Q9Y2V7 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms