Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U9

KLHDC2, Kelch domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC2Q9Y2U9 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHDC2Q9Y2U9 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms