Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms