Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms