Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PALD1Q9ULE6 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PALD1Q9ULE6 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PALD1Q9ULE6 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PALD1Q9ULE6 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PALD1Q9ULE6 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PALD1Q9ULE6 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PALD1Q9ULE6 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PALD1Q9ULE6 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PALD1Q9ULE6 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PALD1Q9ULE6 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PALD1Q9ULE6 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PALD1Q9ULE6 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PALD1Q9ULE6 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PALD1Q9ULE6 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PALD1Q9ULE6 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PALD1Q9ULE6 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PALD1Q9ULE6 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PALD1Q9ULE6 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PALD1Q9ULE6 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PALD1Q9ULE6 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PALD1Q9ULE6 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PALD1Q9ULE6 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PALD1Q9ULE6 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PALD1Q9ULE6 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PALD1Q9ULE6 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PALD1Q9ULE6 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PALD1Q9ULE6 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PALD1Q9ULE6 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PALD1Q9ULE6 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PALD1Q9ULE6 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PALD1Q9ULE6 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PALD1Q9ULE6 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PALD1Q9ULE6 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PALD1Q9ULE6 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PALD1Q9ULE6 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PALD1Q9ULE6 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PALD1Q9ULE6 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PALD1Q9ULE6 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PALD1Q9ULE6 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PALD1Q9ULE6 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PALD1Q9ULE6 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PALD1Q9ULE6 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PALD1Q9ULE6 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PALD1Q9ULE6 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PALD1Q9ULE6 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PALD1Q9ULE6 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PALD1Q9ULE6 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PALD1Q9ULE6 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PALD1Q9ULE6 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PALD1Q9ULE6 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PALD1Q9ULE6 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PALD1Q9ULE6 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PALD1Q9ULE6 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PALD1Q9ULE6 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PALD1Q9ULE6 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PALD1Q9ULE6 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PALD1Q9ULE6 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PALD1Q9ULE6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PALD1Q9ULE6 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PALD1Q9ULE6 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PALD1Q9ULE6 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PALD1Q9ULE6 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PALD1Q9ULE6 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PALD1Q9ULE6 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms