Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms