Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms