Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY4

GGA2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA2Q9UJY4 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GGA2Q9UJY4 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GGA2Q9UJY4 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GGA2Q9UJY4 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GGA2Q9UJY4 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GGA2Q9UJY4 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GGA2Q9UJY4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GGA2Q9UJY4 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GGA2Q9UJY4 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GGA2Q9UJY4 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GGA2Q9UJY4 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GGA2Q9UJY4 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GGA2Q9UJY4 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GGA2Q9UJY4 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GGA2Q9UJY4 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GGA2Q9UJY4 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GGA2Q9UJY4 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GGA2Q9UJY4 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GGA2Q9UJY4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GGA2Q9UJY4 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GGA2Q9UJY4 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GGA2Q9UJY4 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GGA2Q9UJY4 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GGA2Q9UJY4 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GGA2Q9UJY4 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GGA2Q9UJY4 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GGA2Q9UJY4 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GGA2Q9UJY4 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GGA2Q9UJY4 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GGA2Q9UJY4 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GGA2Q9UJY4 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GGA2Q9UJY4 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GGA2Q9UJY4 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GGA2Q9UJY4 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GGA2Q9UJY4 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GGA2Q9UJY4 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GGA2Q9UJY4 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GGA2Q9UJY4 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GGA2Q9UJY4 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GGA2Q9UJY4 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GGA2Q9UJY4 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GGA2Q9UJY4 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GGA2Q9UJY4 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GGA2Q9UJY4 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GGA2Q9UJY4 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GGA2Q9UJY4 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GGA2Q9UJY4 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GGA2Q9UJY4 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GGA2Q9UJY4 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms