Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR1

UPB1, Beta-ureidopropionase, humanhuman

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Length 384 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPB1Q9UBR1 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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