Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ6

EXTL2, Exostosin-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL2Q9UBQ6 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXTL2Q9UBQ6 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXTL2Q9UBQ6 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXTL2Q9UBQ6 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXTL2Q9UBQ6 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXTL2Q9UBQ6 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXTL2Q9UBQ6 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXTL2Q9UBQ6 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXTL2Q9UBQ6 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXTL2Q9UBQ6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXTL2Q9UBQ6 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXTL2Q9UBQ6 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXTL2Q9UBQ6 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXTL2Q9UBQ6 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
EXTL2Q9UBQ6 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms