Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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RNF7Q9UBF6 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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RNF7Q9UBF6 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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RNF7Q9UBF6 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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