Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms