Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms