Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
IGSF9Q9P2J2 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IGSF9Q9P2J2 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
IGSF9Q9P2J2 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IGSF9Q9P2J2 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IGSF9Q9P2J2 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IGSF9Q9P2J2 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
IGSF9Q9P2J2 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IGSF9Q9P2J2 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IGSF9Q9P2J2 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms