Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

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Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNTN3Q9P232 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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