Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms