Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms