Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.5 ms