Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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