Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I1

MTMR12, Myotubularin-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR12Q9C0I1 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC19■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms