Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms