Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY43

CHMP4A, Charged multivesicular body protein 4a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4AQ9BY43 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP4AQ9BY43 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP4AQ9BY43 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP4AQ9BY43 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP4AQ9BY43 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP4AQ9BY43 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP4AQ9BY43 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP4AQ9BY43 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP4AQ9BY43 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP4AQ9BY43 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP4AQ9BY43 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP4AQ9BY43 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP4AQ9BY43 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP4AQ9BY43 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP4AQ9BY43 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP4AQ9BY43 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CHMP4AQ9BY43 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CHMP4AQ9BY43 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP4AQ9BY43 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms