Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms