Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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