Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms