Protein–RNA interactions for Protein: Q99795

GPA33, Cell surface A33 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPA33Q99795 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms