Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms